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生物的多樣性總結范文1
關鍵詞:探究性學習 探究情境 實驗教學 課堂總結
生物是一門以實驗為主的學科,在初中生物課堂上想提高學生的學習效率,完善生物課堂的教學質量,教師需要改觀傳統教學里那種單向輸入的“填鴨式”教學,積極利用探究教學的方法,以幫助學生對生物內容進行深入的了解和剖析,提高學生在學習中的主動性。由于探究性學習是動態變化的,它對教師的課堂調控提出了更高要求,教師如何緊扣生物學科特點,積極搭建平臺,有效引領學生開展探究性學習?
一、巧妙創設探究性情境,為探究性學習注入活力
在生物課堂上,想提高學生的學習興趣,教師可以根據實際的教學內容,為學生創設相關的學習情境,一方面在學生現有的知識基礎上進行交流和提問,另一方面則鼓勵學生對學習內容展開積極探究,以開拓學習思路。初中階段的生物課程對學生以后的學習發展有著十分重要的影響,教師不能盲目采用應試教育背景下的教學方法,要結合實際的教學內容,創設出有趣的教學情境來,從而最大程度的激發學生的探究欲望,使學生在探究中更好地發現知識、獲取知識。
例如在學習《生物圈中生命的延續和發展》這個章節的內容時,教師可以創設出激發學生觀察欲望的教學情境,通過情境讓學生明確觀察探究的學習目的,并在情境中引導學生對相關的觀察方案進行設計,有效借情境將觀察內容和理論知識結合起來,以幫助學生更為深刻地認識學習內容。像利用視頻演示植物的生長過程,可以讓學生探究出“生物的生存都需要營養”這個內容的具體過程;而通過對動物的生活情境進行講述,學生則可以探究出“生物能排出體內產生的廢物”這一理論知識。在情境中,當學生建立了一定的感性經驗之后,教師可以讓學生再次利用網絡或書籍、課后觀察等去了解和構建 “生物的生殖和發育”這些知識,從而促使學生將相關的知識點聯系到一處,建立層次分明的學習結構,以達到提高學習效率??梢哉f,在利用情境教學法幫助學生進行探究的時候,教師要開放自身的教學思維,將教學目光從概念定理的桎梏中擺脫出來,并借情境更好地引導學生開展生物探究,從而有效培養學生的探究思維。
二、巧妙結合實驗內容,為探究性學習注入活力
生物是一項與人們生活息息相關的學科,實驗是學好生物的重要載體,也是教師引導學生開展生物探究的重要過程。教師要重視實驗內容,借助實驗課程開展探究教學,以提升學生對生物的直觀認識程度。同時,為了讓探究過程更有效,教師在教學過程中要指導學生從整體內容來親歷實驗,掌握不同生物的變化規律和生長周期,抓住重點內容引導學生開展足夠細致的觀察,進而提高自身的生物探究學習能力。為了讓探究過程更深入,教師在實驗過程中也可以設計一些探究性的問題,以達到幫助學生在完成實驗內容的同時正確認識觀察的重要性,提高教學質量。
如在進行《觀察根毛和根尖的結構》這個實驗時,教師可以運用探究式教學法,從兩個方面對學生進行引導:一方面是對學生的探究方法進行培訓,在實驗過程中,對學生使用放大鏡和顯微鏡觀察植物組織的方法進行培訓,并借助相關實驗過程使學生掌握顯微鏡等實驗用具的規范用法。另一方面則是引導學生對觀察結果展開探究,像根尖在發育成根的過程中和其結構有怎樣的關聯,而根尖的結構特點又是如何決定根尖的功能等。學生只有利用實驗好對根尖的各部分結構和功能進行探究,才能更好地了解根和根的功能,為后續知識的探究打下良好的基礎。同時,教師要引導學生正確分析實驗結果,對于錯誤的結論進行討論和糾正,并鼓勵學生根據實驗過程,結合教材上的知識點,與同學分享自己的實驗探究結果。
三、巧妙結合總結滲透方法,為探究性學習注入活力
在探究性學習過程中,總結是一種重要的手段,也是學生探究能力不斷得以培養的重要過程,學生可以在探究中分析自己在探究過程中存在的問題,又可以通過總結為以后的探究積累更多的經驗。但在實際教學中發現,部分教師對于探究總結缺乏一個良好的教學策略。有些教師采用“放羊式”的方法讓學生自由總結,有些教師在課堂結束之前并沒有留出一定的總結時間,這兩種情況都大大降低了探究式教學的深度發展。因此,為了完善學習過程,提高學生的探究學習能力,教師要在課堂結束階段幫助學生運用小組合作的方法來對內容進行總結與探究,讓學生立足于學習過程,展開發散性的總結活動,以進一步提高自身知識內容的儲備。
如在學習《生物多樣性及保護》這個章節時,在課堂結束之時,教師可以先引導合作小組對“生物的多樣性及其價值”、“生物多樣性面臨的威脅”和“生物多樣性的保護對策”這三個知識點內容展開梳理,并讓學生對結合知識點展開文章結構脈絡的理解。教師根據學生在課堂總結的表現進行拓展性探究,如“探究生物多樣性的價值,并借助實例來說明生物多樣性的意義”,或者是對“生物多樣性所面R的威脅進行分析,提出相應的保護措施”等,通過探究性知識的拓展幫助學生更好地理解生物多樣性及保護的意義。教材只是生物知識的概括性闡述,而生物探究卻是持續的,教師要借助為學生滲透更多的探究性學習方法,并通過探究讓學生發現更多的生物知識,驗證教材上提出的生物知識,從而不斷豐富自身的知識結構,獲得探究性能力的全面發展。
總之,初中生物是一門探究性很強的學科,由于探究過程充滿著動態變化,教師要用開放的眼光去引導學生展開生物探究,結合實驗過程和學生的學習能力,巧妙挖掘教材中蘊含的探究性知識素材,積極搭建探究性學習平臺,使學生感受到探究過程的樂趣,并在探究過程中更好地發現生物知識、理解生物知識,獲得探究性學習能力的發展。
參考文獻:
[1]高瞻.新課標下中學生物學體現的基本觀點[J].中學生物學,2006,(01).
生物的多樣性總結范文2
近年來,中歐雙方在環境領域,特別是在生物多樣性領域開展了密切而廣泛的合作。在20*年*月舉行的*中歐環境政策部長級對話會上,生物多樣性被確定為中歐環境合作的四個優先領域之一。在中歐雙方的共同努力下,20*年*月雙方簽署了“中國—歐盟生物多樣性項目”協議,該項目已于今年*月正式啟動,示范項目正在緊張有序的進行,已經取得了階段性成果。這次召開的中歐生物多樣性戰略研討會是中歐生物多樣性領域合作的一個重要內容,是做好中歐生物多樣性項目的具體行動。
生物多樣性保護是環境與資源保護的重要內容,是保障生態安全的重要舉措,是經濟可持續發展和社會進步的重要方面。中國是世界上生物多樣性最為豐富的國家之一,僅次于*和*,居世界第三位。中國自19*年加入《生物多樣性公約》以來,為保護生物多樣性、履行國際公約做了大量的工作。通過制定法律、法規和規劃,實施就地和遷地保護,開展科學研究和宣傳教育等手段,中國的生物多樣性得到了有效保護、生態環境惡化的趨勢得到了有效遏制。
中國先后頒布了《環境保護法》、《野生動物保護法》、《森林法》以及《自然保護區條例》、《野生植物保護條例》等一系列法律法規,形成了較為完善的法律管理體系;建立了生物多樣性履約協調機制和生物物種資源保護管理部際聯席會議制度;制定實施了《中國生物多樣性保護行動計劃》、《全國生態環境保護規劃綱要》以及農業七大體系建設、林業六大工程以及種質資源保存等重大行動。截止20*年底,全國共建立各級各類自然保護區2349處,面積150萬平方公里,約占國土面積的15%,初步形成了類型比較齊全、布局比較合理、功能比較健全的全國自然保護區網絡。
在新世紀新階段,中國政府確立了堅持科學發展觀、構建社會主義和諧社會,實現人與自然協調的指導方針,確立了建立資源節約型、環境友好型社會的基本方略。中國已經明確把生物多樣保護納入了國民經濟和社會發展十,國務院實施的《關于加強環境保護工作的決定》,對有效保護生物多樣性提出了明確要求;今年召開的第六次全國環保大會,明確提出在新的時期,中國的環境保護工作要實現三大歷史性轉變。明天,將召開中國自然保護區發展五十周年紀念大會,中國國務院領導將出席紀念大會,參加紀念大會的還有各有關部門領導和地方代表。這次紀念大會將對我國自然保護區工作五十年來所取得的經驗進行總結。所有這些,為我們進一步做好環境保護工作,推動生物多樣性保護與可持續利用指明了方向。
當前,中國的環境保護工作正處在關鍵時期,實現新時期環境保護工作歷史性轉變,完成國家確定的環境保護目標和任務,明確發展戰略、加強能力建設至關重要。作為發展中的大國家,推行大規模的環保戰略和行動,需要加強國際合作,學習其他國家先進的環保理念、經驗和技術。
中國政府高度重視與歐盟的合作。中歐生物多樣性項目的啟動就是雙方深化合作、共同保護生物多樣性的重要里程碑。雙邊合作,重要的是構建穩固的合作平臺,建立靈活的合作機制。雙方應本著平等、互信、共贏的原則,以合作機制為橋梁,以合作項目為平臺、通過經驗交流、人員培訓以及項目援助等方式,讓中國充分積累經驗、克服現有困難,實現生物多樣性保護工作的大突破,促進、推動雙方生物多樣性保護工作的開展。目前,我們希望與歐盟在生物多樣性領域在三個方面加強合作與交流。一是生物多樣性保護監督體系,即生物多樣保護的的法律體系、管理體系和政策制定等;二是生物多樣性監測與評價體系,即生物多樣性監測網絡建設,生物多樣性評價方法和生物多樣性信息交換機制等;三是生物多樣性保護融資,即生物多樣性保護國際融資渠道、國內財政機制等。通過這三個方面的合作,在自然保護區建設、生物物種資源保護和生態功能區規劃等領域加強合作的廣度與深度。以此充分有效的保護中國的生物多樣性,建立完善的生物多樣性保護能力保障體系。
生物的多樣性總結范文3
“動物的主要類群”一課是義務教育生物課程標準實驗教科書北師大版《生物學》八年級下冊第7單元“生命的演化”中第22章“物種的多樣性”第3節。本節與前一節的植物的主要類群和后一節的細菌、真菌、病毒等,同屬于“生物的多樣性”這一主題。本章對幫助學生理解保護生物多樣性的意義,形成生物進化的觀點都有重要意義。
“動物的主要類群”一節可以分成3課時。第1課時主要內容是無脊椎動物主要類群,第2課時的主要內容是脊椎動物與無脊椎動物的主要區別和脊椎動物中的魚類兩棲類特征,第3課時的主要內容是脊椎動物中的爬行類、鳥類和哺乳類特征及動物進化系統樹。
隨著生物學的發展,傳統的生物分類內容在生物學所占的比重有所縮減。因此,這一節的設計重點應放在培養學生對生物學的興趣、學習方法的指導上,而不是去關注每種動物類群到底有什么樣的細微差別。教學過程則應以學生的活動、體驗為主,教師可以引導學生自己獲取和整理相關的知識。
2教學目標
2.1知識目標
能區別常見的脊椎動物與無脊椎動物;能說出魚類和兩棲類的主要形態結構和生理特征;能列舉魚類和兩棲類的常見種類。
2.2能力目標
通過對17種“動物實物或標本的觀察”、“區別無脊椎動物和脊椎動物”、“區別魚類、兩棲類”等活動,增強學生的觀察力、閱讀能力、分析問題能力和語言表達能力。
2.3情感態度與價值觀目標
通過對不同類群動物的對比學習,強化生物進化的觀點,進一步體會生物的多樣性;通過對動物與人類關系的學習,進一步強化保護動物多樣性的觀念。
3課前準備
草履蟲錄像和???、豬帶絳蟲、蚯蚓、沙蠶、河蚌、烏賊、沼蝦、鯽魚、鯊魚、海馬、青蛙、蠑螈、蜥蜴、野鴨、啄木鳥、家兔、松鼠17種動物實物或標本。
實驗報告單:上面印有1~18的編號、需要學生填寫名稱和類別的部分以及30種備選動物名稱。
3教學設計思路
3.1
學生觀察辨認17種動物實物或標本
這是本節的一個重要活動。即在實驗室中放置17種代表性的動物實物或標本并編號,請學生們觀察,比較,并寫出它們的名稱。這個活動的設計意圖是通過觀察形形的動物,讓學生體驗學習生物的樂趣,體驗動物的多樣性,對不同動物類群的形態結構特征形成初步的感性認識,并為引導學生理解脊椎動物與無脊椎動物的主要區別、不同脊椎動物類群的主要特征和代表動物作好鋪墊。
3.2學生從這17種動物中依次選出脊椎動物、魚類、兩棲類并說明理由
通過指導學生看書、結合學生在觀察辨認17種動物實物和標本活動中形成的感性認識、生成的疑惑和已有知識經驗,讓學生自己歸納總結脊椎動物與無脊椎動物的區別、魚類和兩棲類的主要特征。
3.3
學生認識魚類和兩棲類的其他常見種類并說出它們與人類的關系
通過觀看大量的相關動物圖片和學生的介紹,進一步體會生物的多樣性、強化保護動物多樣性的觀念。
4教學過程
4.1任務驅動,導入新課
請科代表提前分發實驗報告單。展示第1號動物“草履蟲”的錄像,請學生將名稱填寫在報告單的1號位置。同時布置任務:在隔壁實驗室還放置了17種動物的實物或標本,給10 min的時間,請同學們仔細觀察辨認,并在報告單相應的位置寫下它們的名稱。
4.2觀察合作,完成任務
學生進入實驗室,按要求觀察、辨認17種動物,并在報告單相應的位置寫下它們的名稱。10 min后,教師用哨聲通知學生回教室。請17名學生依次回答2~18號動物的名稱,檢測學生的活動完成情況:17名學生都能正確回答。
4.3
區分脊椎動物和無脊椎動物
布置任務:請將這18種動物中不是脊椎動物的挑選出來。通過學生回答發現學生能準確選出。于是繼續提問:為什么把這7種動物挑選出來?脊椎動物與無脊椎動物的主要區別是什么?學生回答并總結脊椎動物的基本特點:身體里有脊椎骨。接著展示4種脊椎動物鯽魚、青蛙、家鴿、家兔的骨骼標本,強化學生對脊椎動物基本特點的理解。
4.4引導互助,學習魚類特征
布置任務:請將余下的這11中脊椎動物中的魚類挑選出來。在挑選魚類的時候,學生意見不太統一,他們對鯊魚是不是魚、海馬是不是魚有爭議。于是教師再提問:你認為魚應具有哪些特征?有學生提出魚類的特征有水生、鰓呼吸、有鱗片等。但表述不夠準確,也有一些不正確的地方。這時教師再引導學生看書,根據生活環境、體表、呼吸器官、生殖方式等去方面尋求答案。學生得到答案后,教師再引導學生判斷鯊魚和海馬是不是魚,答案就很統一了。接著,教師再播放一些魚類的圖片,學生觀看后自己總結魚類與人類的關系。
4.5發現解決問題,學習兩棲類特征
學習兩棲動物的特征時,有學生通過看書發現蠑螈、大鯢這類兩棲動物終生生活在水中,提出了自己的困惑:“兩棲動物不是可以水陸兩棲嗎?”教師沒有直接解答,而是把這個問題交給了其他學生。很多學生都肯定兩棲動物并不是指既能水生又能陸生的動物。教師又提問:到底什么是兩棲動物呢?并引導學生們仍然根據生活環境、體表、呼吸器官、生殖方式、等去思考。通過學習同學們認識到,兩棲動物幼體具有水生動物(魚)的特征,而成體具有陸生動物的特征。這時教師再強調,兩棲動物其實是一種水生向陸生過渡的類型,而不是真正的能自由選擇在水中還是在陸地生活的動物。接下來,再播放一些兩棲類的圖片,請同學們觀看并總結兩棲類與人類的關系。
4.6課后思考,留下伏筆
教師提出課后思考問題:蜥蜴是兩棲動物嗎?蝙蝠為什么不是鳥?藍鯨為什么不是魚?
5課后反思
由于教學設計過程中以學生的活動、體驗為主,學生們興致很高,注意力很集中。由于考慮了活動的一些細節,如準備報告單,實物標本的選擇、安放位置等,觀察活動很有序地進行。安排學生將報告單上18種動物按脊椎動物、魚類、兩棲類等一步步篩選出來,這種過渡方式能很自然地后將前后內容銜接。
生物的多樣性總結范文4
關鍵詞: 氨基酸 結構通式 脫水縮合 肽鍵 肽鏈
一、氨基酸
蛋白質的基本組成單位是氨基酸,約有20種。其結構通式
連接兩個氨基酸分子的化學鍵(-NH-CO-)叫做肽鍵。由兩個氨基酸分子縮合而成的化合物,叫做二肽。由多個氨基酸分子縮合而成的,含有多個肽鍵的化合物,叫做多肽,多肽通常呈鏈狀結構,又叫肽鏈。一條或多條肽鏈能彎曲、折疊,形成有一定空間結構的蛋白質分子。
三、蛋白質結構的多樣性
1.蛋白質結構的多樣性取決于:構成蛋白質的氨基酸種類、數目、排列順序和蛋白質的空間結構。
2.氨基酸的排列與多肽的種類:
四、相關計算
根據蛋白質合成過程,采用圖形和公式法總結相關規律,就可以熟練掌握有關蛋白質類物質的計算問題。
(一)示意圖
注意:1.直鏈肽鏈:(1)氨基酸個數-肽鏈數=肽鍵數=脫去的水分子數;(2)蛋白質中含有多少個肽鍵,形成時就失去多少個分子的水,完全水解時就需加入多少個分子的水;(3)有幾條肽鏈至少有幾個氨基和幾個羧基,故蛋白質中氨基或羧基數目=肽鏈條數+R基中氨基或羧基數;(4)蛋白質的相對分子質量=氨基酸的平均相對分子質量×氨基酸數目-水分子數目×18。
2.環形肽鏈:(1)氨基酸個數=肽鍵數=脫去的水分子數;(2)蛋白質中含有多少個肽鍵,形成時就失去多少個分子的水,完全水解時就需加入多少個分子的水;(3)環形肽鏈最少有0個氨基和0個羧基,故蛋白質中氨基或羧基數目=R基中氨基或羧基數;(4)蛋白質的相對分子質量=氨基酸的平均相對分子質量×氨基酸數目-水分子數目×18。
生物的多樣性總結范文5
關鍵詞: 種群密度 物種多樣性 模擬實驗 棋盤法
高中《生物》第3冊第四章第一節“種群的特征”中安排了一個探究實驗“用樣方法調查草地中某種雙子葉植物的種群密度”。這個探究實驗由于需要野外操作,因而會出現很多制約因素,比如植物識別是否準確,樣地選擇是否合適,時間安排是否及時,學生安全是否保證等等。本文通過借鑒大學教材《生態學實驗》,對其加以改良,將野外實驗搬進了實驗室,使之成為模擬實驗,既能準確地體現實驗原理,又能克服實際中的諸多不便。具體操作如下:
一、基本實驗流程
教師先給出基本的實驗材料。
1.準備一個1m2木盒(10格×10格),將其模擬為野外樣地,將木盒內100個小方格編號:00~99,每個小方格相當于一個樣方;
2.準備一包一定數量的黃豆(500粒,事先不要告訴學生)。[1]
引導學生分組討論后續實驗步驟如何設計,各組展示設計方案,教師加以總結后補充實驗方案如下:
3.以黃豆模擬待測種群,將其隨機散布在木盒內;
4.隨機抽取樣方;
5.分別計數已抽取樣方中的個體數量;
6.計算每個樣方內平均個體數,然后乘100,即為種群數量的估計值。
之后師生進行了如下對話,
師:各小組討論一下,這個過程中還有什么疑難問題?
生:如果黃豆壓線,如何計數?
師追問:如果全部計數是否準確?
生:不準確,會造成重復計數。
師:對,為了避免重復,應取上邊,左邊,左上角處計數,即按照取左上原則處理。[2]
二、實驗后關鍵問題的討論
各組匯總結果后,教師公布每組黃豆真實數量為500粒,之后各組討論如果誤差較大,可能的原因是什么?
經過討論之后,師生共同總結出可能的原因有3個:
1.散播黃豆時,沒有隨機進行。比如沒有散開,大部分集中在某一區域。[3]
2.抽取樣方時,沒有隨機進行。應該是一位小組成員背對棋盤,隨機報樣方號,以保證不受主觀影響。
3.抽取樣方數量太少。取樣小于20個樣方的小組都有較大誤差,為保證準確性和高效性,應取20個樣方為宜。
三、由模擬走向現實,由室內走向野外
如果直接進行野外實驗,學生因為沒有相關知識鋪墊,只能被動接受相關知識,而在開展了模擬實驗后,便可引導學生進行創新性發散思維,思考野外調查植物種群密度應如何進行呢?經過學生小組討論后,師生共同總結有以下幾個方面:
1.選定樣地;
2.根據種群個體疏密程度,確定樣方面積及數量,密度大的樣方可以小些,需要提前進行預實驗加以確定;
3.隨機抽取樣方,計數樣方內的個體數,并計算種群密度。
四、進一步通過模擬實驗探究植物的物種多樣性
不僅如此,教師還可以引導學生進行小組討論:如何利用棋盤法調查植物物種多樣性(滬教版為必修內容,其他地區教師可針對性指導學生進行拓展實驗)。經討論,總結方案如下:
1.將木盒內100個小方格編號:00~99;
2.將混好的各色豆隨機散布在木盒內,其中不同顏色的豆相當于不同植物種群(每組中豆的種類以及各種豆數量有所不同);
3.隨機抽取樣方20個;
4.分別計數已抽取樣方中的各種豆的數量;
5.利用辛普森指數,計算群落的物種多樣性。
經過實驗之后,各組展示實驗結果,并討論物種豐富度(取決于豆的種類數)和物種均勻度(取決于各種豆數量的接近程度)對物種多樣性的影響。[4]
綜上所述,通過實驗室模擬的方法開展探究實驗,既能準確地體現實驗原理,又能克服野外實際中的諸多不便,而且在實驗過程中并不是一味將知識灌輸給學生,而是只給出基本的模型用具,使用探究性實驗教學,讓學生分組討論,充分調動學生的積極性,引導他們充分思考,從而達到良好的教學效果。[5]
參考文獻:
[1]李銘紅.生態學實驗.浙江大學出版社,2010(11).
[2]朱鈞樣.“方法調查草地中某種雙子葉植物的種群密度”的模擬實驗.新課程學習(中), 2011(4)
[3]朱俊.種群密度的調查及誤差分析.考試(高中理科),2014(2)
[4]唐杰.“模擬動物種群密度調查的標記重捕法”實踐的一些改進.中學生物,2014(3)
[5]陳蓉.高中生物探究性實驗教學探討.課程教育研,2014(1)
生物的多樣性總結范文6
關鍵詞:熱液 羽流 微生物分子生態 西南印度洋洋中脊
中圖分類號:Q93
文獻標識碼:A
文章編號:1007-3973(2012)003-094-041 前言
自從1977年美國深海探測器“阿爾文”號在加拉帕戈斯大裂谷深處首次發現熱液噴發,一個以化能合成為基礎的“黑暗生物圈”震驚了整個生物界和地學界。熱液從海底噴口噴發,與含氧的深海海水混合,高濃度的無機物為微生物生長繁殖提供了大量的能源和物質,引發微生物旺盛的化能合成新陳代謝,維持著高豐度多樣性的生態系統。雖然近噴口的環境得到了廣泛的關注,但是分散消耗更多地熱能距離噴口數百米連綿數百公里的熱液羽狀流卻沒有得到足夠的重視。在羽流中,氫氣、甲烷、氨、硫、鐵、錳等都存在強烈變化,它們不僅為化能無機自養提供能源,并且是深海有機碳的重要來源。因此,通過熱液羽流微生物對物質能量的作用,一個從海底到海表,從巖石圈到生物圈新的海底生態系統誕生了。
現代分子生物學方法尚未廣泛應用于深海熱液羽流,因此對羽流微生物的習性、來源以及生態還知之甚少。早期研究顯示了羽流中微生物相對于背景海水其生物量增加,微生物活動增強,而最近的研究則漸漸了解了一些特定微生物的生態特征,例如厭氧氨氧化細菌。然而,并沒有研究從根本上解決深海熱液羽狀流微生物生物地球化學過程的本質。要解決這個關鍵的問題就必須了解熱液羽流中微生物的生態群落結構及其環境制約的具體體現。
本文對西南印度洋洋中脊熱液羽狀流進行科考采樣,通過16S rRNA序列測定以及系統發育分析,對其中甲烷異常層熱液羽流中的細菌、古菌的系統發育樹進行分析,并加以初步總結。
2 材料和方法
2.1 采樣地點
樣品位于西南印度洋洋中脊水深約2800m的甲烷異常熱液羽狀流。西南印度洋洋中脊(SWIR)是非洲板塊和南極洲板塊之間的主要邊界,從西端的布維三聯點(Bouvet Triple Junction, BJT)到東端的羅得里格斯三聯點(Rodrigues Triple Junction,RTJ),全長約8000km。按幾何形態和擴張歷史,將SWIR從西至東分為7段,采樣點位于Marion轉換斷層和Gallien轉換斷層之間的第五段,隆起相對較高,軸向深度相對較淺,是全球為數不多的超慢速擴張的洋中脊之一。
2.2 采樣方法
樣品經由SBE 19plus CTD(sn:5120)采集之后,選取羽流層2L水樣真空抽濾過0.22um微孔濾膜,收集濾膜在2ml EP管中,冷藏保存于-80℃。
2.3 基因組 DNA的提取
實驗采用gDNA Extraction(DNA物理提?。┓椒?,通過加入適量DNA提取Buffer后,將EP管反復放入液氮和65℃水浴鍋中進行破壁,加入適量蛋白酶、SDS,而后按照酚仿—氯仿—異戊醇的順序進行抽提轉移,最后重復使用乙醇進行洗滌,轉移加入100%el滅菌水入EP管保存于-80℃。Extraction buffer包括:100 mM Tris-HCl (pH 8);100 mM Na2-EDTA;100 mM NaH2PO4 (pH 8);1.5 M NaCl;1% CTAB。
2.4 PCR體系與程序
實驗采用Biometra公司Tprofessional Thermocycler型PCR儀,使用Di Cello F提出的50%el PCR體系,包括:DNA模板,2 %el(10-20ng);雙向擴增引物,2%el;Taq DNA聚合酶,2%el;2.5mmol/l dNTP,4%el;10譖CRbuffer,5 %el;25 mmol/l MgCl2 3%el;最后用 ddH2O補至 50 %el。
2.5 測序與系統發育分析
割膠純化 PCR 產物,與TaKaRa公司pMD18-T vector載體(載體序列:GCTTGCATGC CTGCAGGTCG ACGATt——ATCTC TAGAGGATCC CCGGGTACCG)連接, 轉化大腸桿菌,涂板培養,挑取陽性克隆子送樣測序 (上海杰李生物科技有限公司),用 DNAMAN、Gene Tool 等軟件對測序結果進行編輯分析,在 GenBank 數據庫中進行Blast同源性檢索后下載同源性序列,使用Clustal X 以及Mega 5.0軟件進行親緣關系分析,采用鄰接法(neighbour-joining-analysis)構建系統發育樹。3 實驗結果與討論
3.1 文庫稀釋曲線及多樣性指數