醫學期刊數據出版政策

前言:尋找寫作靈感?中文期刊網用心挑選的醫學期刊數據出版政策,希望能為您的閱讀和創作帶來靈感,歡迎大家閱讀并分享。

醫學期刊數據出版政策

科研數據是科研成果的重要支撐材料,也是科研活動的重要產出。但在以往的很長一段時間內,科研數據只是保存在科研工作者個人手中或實驗室里,隨著科研過程的結束而逐漸被擱置,甚至丟失。伴隨著數據密集型科研活動的蓬勃發展,科研成果的再現以及相關假設的進一步探索都需要獲取這些原始數據,科研數據的開放獲取受到科研過程中利益相關者(政府監管部門、資助機構、期刊編輯、研究人員)的關注,越來越多的資助機構以及國際學術組織提出開放數據政策,要求科研數據能夠公開可獲取,以幫助驗證、推進科學研究。數據出版(DataPublishing/DataPublication)是近幾年出版界和數據共享界共同提出和積極探索的新概念,是數據共享的新機制。Pene等認為數字時代的數據出版是指在互聯網上公開數據,并支持除數據提供者之外的研究人員或者組織機構下載、分析、再利用以及引用數據;從廣義上講,任何將數據上傳到互聯網或者數據庫并支持開放獲取的行為都可以稱之為數據出版。吳立宗等認為科學數據出版是指將數據作為一種重要的科學成果,從科學研究的角度對科學數據進行同行審議和公開公布,并創建標準和永久的數據引用信息,供其他研究性文章引證。國內外數據出版定義的表述略有差別,國外的定義側重共享,國內更接近于傳統論文出版,有完整的流程和控制標準。近年來,越來越多的學術期刊了數據出版政策,研究人員對這些政策開展了調研分析。如陳秀娟等以美國化學學會期刊為例剖析化學學科的學術期刊數據出版政策;雷秋雨等分析了《期刊引用報告》(JCR)中進化生物學領域期刊的數據出版政策。本文以醫學領域的核心期刊為例,系統地研究醫學領域學術期刊的數據出版政策。之所以選擇醫學領域,主要是因為該領域在數據共享政策規定方面的發展較為成熟,能為國內同類期刊、期刊編輯制定和完善數據出版政策提供參考,也能幫助醫學領域的科研人員了解相關數據出版政策和要求,便于他們投稿和共享科研數據。

1研究對象和內容

選取中科院科學引文索引(SCI)期刊分區表中醫學大類1區里影響因子排名在前50的期刊為樣本進行研究,這些期刊是中科院依據美國科學信息研究所(ISI)的JCR列出的醫學領域中影響力最大的期刊,在醫學領域的期刊中極具代表性和權威性。截至2017年2月20日,中科院SCI期刊分區表中1區醫學大類里影響因子排在前50的期刊,按照影響因子從大到小的順序編號,下文如再次出現,將以編號代替。筆者調研了這些期刊的網站,并對每種期刊的“AuthorInstructions”部分進行了詳細調查,調研的內容均為2017年2月的最新版本。對期刊是否要求作者提交支撐性數據或補充數據材料進行出版的論述進行統計,將這些期刊的數據出版政策按照強弱等級細分為4個等級;依據統計結果,進一步調查各個期刊對于數據發表和數據共享的要求和表述,如要求作者提交何種數據、如何提交、提交于何處,以及數據的開放性規定,并進行歸納總結;選取具有代表性的學術期刊,詳細介紹其政策規定。

2概況

對表1中50種學術期刊的數據出版政策進行研究,發現有3種期刊沒有數據存繳要求,其余47種期刊均要求作者將相關數據或補充材料作為支撐信息(SupportingInformation,SI)隨論文一起提交。SI是指能夠直接支持論文的主要結論,但對主要結論而言是額外的或次要的,或因為空間或者格式限制等原因不能被列入論文主體中的數據或其他材料。在期刊允許的情況下,同行評審過程中評審專家可以將SI作為評審參考;在以后,SI也會隨論文電子版以期刊規定的相應形式發表,感興趣的科研人員可以獲取所需數據并再現作者的研究成果。對有數據存繳和出版政策的47種期刊進行調研發現,出版社對SI的提交要求通??煞譃橐韵?種:1)作者及時提交SI并愿意出版是論文出版的條件之一,不提供SI的論文可能會被期刊編輯拒絕發表;2)建議或鼓勵作者將相關數據作為SI同論文一起在線出版,但提交SI不作為論文是否出版的考量,由作者自己決定;3)作者可以提交相關數據作為SI,但SI是否在線出版由期刊編輯決定。按政策強弱細分標準,將每種期刊的“AuthorInstructions”論述中出現“作為論文出版條件”“作者必須提交”“必須愿意出版”等字眼,定義為強數據出版政策;論述中出現“鼓勵提交”“建議提交”“應該提交”“可以提交”這些字眼,同時出現“只要作者愿意就提供在線出版”定義為次強數據出版政策;論述中出現“應該提交”“可以提交”,同時出現“由期刊編輯決定是否出版”定義為弱數據出版政策。比照上述標準總結出,在50種期刊中,3種期刊沒有數據出版政策,占6.0%;10種期刊具有強數據出版政策,占20.0%;22種期刊具有次強數據出版政策,占44.0%;15種期刊具有弱數據出版政策,占30.0%。由此可見,只有少部分期刊具有強數據出版政策,數據出版政策的強制性力度并不大。有數據出版政策的47種期刊中,只有少數需要由編輯來決定提交的數據是否能夠作為SI在線出版,大部分期刊只要作者愿意,就能夠提供在線出版,可見SI的出版條件比較寬松和簡單。

3期刊數據出版政策分析

3.1數據類型

有數據出版政策的47種期刊依據該期刊自身特點,對以SI形式提交的數據類型有不同程度的要求。屬于同一出版集團的期刊通常具有相同的數據出版政策,以SI形式提交的數據類型相同,比如Nature出版集團系列期刊、Lancet系列期刊和AnnualReview系列期刊。所有期刊都說明了SI中可以包含圖、表、數據集、音頻、視頻等通用數據類型,有一些期刊還說明SI中可以包含蛋白質序列數據、DNA和RNA序列數據、大分子結構數據、微陣列數據、計算機代碼和臨床試驗數據等特定數據類型。不同期刊對SI數據的格式有不同的要求,某些特定數據類型被要求先存儲到推薦的相應第三方倉儲中,而其他的數據類型則可以根據期刊要求以pdf、doc、excel、mov、mp3或zip等文件形式直接上傳。

3.2數據存儲位置

數據存儲位置是期刊數據出版政策的重要組成部分??傮w上說,大部分期刊都允許將通用數據直接提交到期刊平臺上,特定數據類型則需要提交到適當的公共倉儲中,形式不一而足,具體來說,目前主要有以下幾種數據存儲方式。

(1)直接提交到期刊平臺上,由期刊進行存儲管理

有數據出版政策的47種期刊都支持通用數據以該方式存儲,但有些對文件的數量和大小有限制。如Lancet系列期刊要求音頻、視頻材料的容量小于50MB;EuropeanHeartJournal要求補充材料不超過10個文件,每個文件不超過1.5MB。

(2)提交到適當的公共數據倉儲中

公共數據倉儲是分享科研數據的較優方式。與期刊平臺的存儲相比,公共數據倉儲使數據更容易被發現和獲取,并提供數據的格式化存儲,支持特殊領域的數據報道標準,特別適合對特定數據類型的存儲。有數據出版政策的47種期刊中,明確規定和要求將特定數據類型存儲到推薦的公共數據倉儲的期刊有28種,其中,Nature系列期刊、Lancet系列期刊、ElsevierCell系列期刊甚至為每種數據類型推薦了相應的數據倉儲清單。如果某些特殊數據類型找不到合適的存儲位置,可選擇通用倉儲進行存儲,如Figshare、Dryad。更多的數據倉儲還可以參照期刊認可的推薦列表,如ScientificData、Biosharing整理的倉儲信息。

(3)作為數據論文出版

數據論文是近年來興起的數據出版形式。與學術論文不同,數據論文的主要內容是數據收集、獲取和處理等過程和方法的描述,不涉及數據和研究結果的分析、推論、假設和驗證。通過這種出版形式,數據可以像學術論文一樣納入到學術評價體系,促進數據分享、獲取和重用。Nature集團從2014年開始出版的數據期刊ScientificData,它的主要文章類型是DataDescriptor,它主要提供對數據細節的描述,闡述數據如何被產出、被誰產出以及如何能夠被其他研究者再利用。出版的DataDescriptor將與相關的期刊論文和存儲在數據倉儲中的數據文檔鏈接。調研中涉及到的11種Nature集團的期刊都支持作者將補充資料以數據論文形式出版。

(4)存儲到作者所在機構的網站或機構庫中

PhysiologicalReviews允許研究人員將補充材料存儲在作者所在機構的網站中,并在論文中按照規定格式提供鏈接到數據集的統一資源定位符(URL)。

(5)作者自行保存一定時間

EuropeanUrology不保存論文的補充數據,而是建議作者在論文出版之時起將數據集凍結5年。如果同行評議需要驗證方法和數據的有效性,作者需要提供匿名的數據集;當其他研究人員提出合理的數據利用需求時,EuropeanUrology鼓勵作者提供,但認可不同國家對作者義務的不同規定。

3.3數據可用性聲明

所有47種有數據出版政策的期刊都明確說明SI數據不會放在印刷本期刊中,而是以電子方式出版。大多數期刊會在印刷稿中聲明補充材料SI可在出版期刊電子版的網站中獲取。在線出版時,不同期刊對SI數據獲取方式的聲明和提示目前還沒有統一的標準,但大多數遵循以下幾種方式:(1)在期刊網站稿件內容發表頁面或旁邊提示如SupplementalMaterials字樣的鏈接,可通過鏈接獲取數據;(2)在稿件的方法部分聲明SI文件獲取事項,如沒有方法部分,在參考文獻或致謝部分之前聲明;(3)在文中與數據相關的內容部分引用,通過超鏈接獲取文件,普通數據通常要求單獨編號(如SupplementaryFigureS1),特定數據類型在論文中標識數據集的訪問控制號、鏈接或DOI號;(4)向作者申請獲取。

4結論

從調研結果可以看出,國際頂尖的醫學期刊已經積極地介入科研數據的管理過程,紛紛發表數據出版政策。了解期刊的數據出版政策,期刊出版社可以緊跟國際期刊的政策形勢;投稿的科研人員可以準確把握期刊要求,提高投稿效率;而需要復用數據的科研人員可以方便獲取所需的科研數據。目前,期刊數據出版政策已經較完善,涉及很多方面,如數據存繳的時間、數據格式、隱私信息的處理。但筆者認為還有許多問題值得進一步改進和探討。(1)數據出版政策的強制力度不夠,有數據出版政策的47種期刊中,只有10種有強數據出版政策,其余37種期刊都只是建議或者鼓勵提交數據進行出版,主要取決于作者本人的意愿,并未形成一種客觀上的要求,在數據共享方面沒有形成強有力的支持。(2)沒有良好的數據質量控制標準,絕大部分有數據出版政策的學術期刊都說明由作者自行對數據的質量、真實性等情況進行負責,沒有設定專門的數據標準審核專家對數據進行評審,無法保證數據的規范性和質量,并不利于數據的有效復用。(3)數據描述和可使用性不足,大部分期刊提供直接將數據存儲在期刊平臺上,并且只是在期刊原文的電子版中提供訪問鏈接,有一些期刊甚至要求除了音頻、視頻文件和大數據集的其他數據都放在一個PDF文件中,并沒有對數據內容的單獨描述以及結構化存儲,不便于對數據的檢索、查看和重復利用。(4)期刊平臺與第三方倉儲整合不足,在上述調研中,只有ScienceDirect平臺出版的期刊提到在第三方倉儲有相關數據時,會出現倉儲標識,其他要求將特定數據類型數據存儲到第三方倉儲中的期刊,只要求提供在第三方倉儲中的獲取鏈接或獲取編號。

亚洲精品一二三区-久久